Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms