Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms