Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms