Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPCQ01831 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPCQ01831 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPCQ01831 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPCQ01831 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPCQ01831 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms