Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN7AQ01118 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms