Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms