Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB1P82279 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms