Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMF1P82094 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMF1P82094 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMF1P82094 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMF1P82094 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMF1P82094 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMF1P82094 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms