Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms