Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CXCL6P80162 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms