Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB1P62873 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms