Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP25P60880 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms