Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCDC1P59894 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.2 ms