Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP7P55210 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP7P55210 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms