Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA4P51532 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA4P51532 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms