Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms