Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRATP43155 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRATP43155 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms