Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms