Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDRP35968 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDRP35968 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDRP35968 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDRP35968 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDRP35968 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDRP35968 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDRP35968 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms