Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF93P35789 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF93P35789 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms