Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRS3P32247 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms