Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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