Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E2P29084 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms