Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms