Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD1P28340 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD1P28340 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD1P28340 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLD1P28340 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms