Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEX2P28328 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms