Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms