Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMLP26374 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms