Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms