Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPREP23469 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPREP23469 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPREP23469 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPREP23469 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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