Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERBB3P21860 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERBB3P21860 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms