Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCL3P20749 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms