Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT1P17948 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT1P17948 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT1P17948 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT1P17948 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT1P17948 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT1P17948 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLT1P17948 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms