Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRFP10586 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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