Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL8P10145 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms