Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms