Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP10P09238 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP10P09238 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP10P09238 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP10P09238 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms