Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMBP08118 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMBP08118 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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