Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPM2P07951 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPM2P07951 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPM2P07951 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPM2P07951 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPM2P07951 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPM2P07951 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPM2P07951 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms