Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PF4P02776 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PF4P02776 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PF4P02776 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PF4P02776 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PF4P02776 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PF4P02776 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PF4P02776 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PF4P02776 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms