Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA3O96018 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APBA3O96018 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APBA3O96018 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA3O96018 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms