Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C6orf47O95873 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C6orf47O95873 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms