Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG7O95352 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG7O95352 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG7O95352 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG7O95352 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG7O95352 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms