Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLIT2O94813 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLIT2O94813 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms