Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN5O75503 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN5O75503 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN5O75503 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms