Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms