Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMDSO60547 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms