Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPLO60437 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPLO60437 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPLO60437 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPLO60437 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPLO60437 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPLO60437 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPLO60437 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPLO60437 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPLO60437 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPLO60437 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPLO60437 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPLO60437 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms