Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUX2O14529 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CUX2O14529 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CUX2O14529 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CUX2O14529 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUX2O14529 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CUX2O14529 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CUX2O14529 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUX2O14529 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUX2O14529 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUX2O14529 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUX2O14529 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUX2O14529 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUX2O14529 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
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