Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms